Aunque la bandera suiza parece responder perfectamente a las características de un país con cuatro lenguas oficiales, es fruto de la pura casualidad. La mundialmente famosa bandera nacional tiene una agitada historia a lo largo de las últimas siete décadas. La bandera suiza fue declarada oficialmente emblema nacional de Suiza en 1848, pero su importancia se remonta a 1339, cuando una cruz blanca sobre fondo rojo simbolizó la unificación de los Waldstätten (Uri, Schwyz, Unterwalden y Lucerna) y el cantón de Berna en la Batalla de Laupen.
No fue hasta 1450-1520 cuando la cruz suiza y la bandera suiza se convirtieron en el emblema estatal de la Antigua Confederación Helvética. Con ello se pretendía distinguirla directamente de la Cruz de San Andrés de Borgoña, utilizada por los mercenarios alemanes.
Tras el fin de las Guerras Confederadas en 1515, las tropas mercenarias suizas que luchaban en el extranjero también llevaban la cruz suiza como distintivo. Sin embargo, las banderas que utilizaban diferían en los colores y los dibujos empleados en las cuatro esquinas. Estas banderas a menudo contenían también símbolos locales que indicaban la afiliación inmediata de los mercenarios.
La "Cruz Suiza" se utilizó por primera vez en la guerra para ayudar a los soldados a reconocerse en el campo de batalla. Más tarde, en 1800 y 1815, Niklaus Franz von Bachmann introdujo una cruz blanca sobre fondo rojo como símbolo de campo para sus tropas. Desde 1815, el sello federal (que se añadió por primera vez al Tratado Federal) consiste en una cruz blanca isósceles, vertical y flotante, rodeada por las armas cantonales del Parlamento Federal sobre fondo rojo.
Por iniciativa de Guillaume-Henri Dufour, en 1840 se creó la primera bandera militar nacional suiza. Cuarenta y nueve años más tarde, en 1889, el Consejo Federal determinó que los cuatro brazos igualmente largos de la cruz debían ser una sexta parte más largos que anchos. Durante la República Helvética (1798-1803), Napoleón Bonaparte ordenó a Suiza utilizar un tricolor verde, rojo y amarillo, que fue abandonado inmediatamente después de su caída.
La ley establece las proporciones exactas de la cruz blanca y la forma cuadrada de la bandera. No obstante, existen diferentes formas de banderas, como la bandera de la marina mercante suiza. Fue creada en 1941, y desde 1953 se define como rectangular. Los atletas de los Juegos Olímpicos también desfilan bajo una bandera rectangular, y la Fuerza Aérea Suiza enarbola una escarapela con una cruz blanca sobre fondo rojo.