Creada en 1985, esta bandera es relativamente nueva. Antes, la bandera de Guernesey consistía en una simple cruz de San Jorge, roja sobre fondo blanco. Pero esto dio lugar a cierta confusión, ya que Inglaterra utilizaba la misma bandera. Así, por ejemplo, en los Juegos de la Commonwealth, cuando competían los equipos de Inglaterra y Guernesey, los demás competidores pensaban que Inglaterra tenía dos equipos.
Así que Guernsey decidió que era necesaria una nueva bandera. Se formó un comité que, tras mucho pensar e investigar, propuso seguir utilizando la cruz de San Jorge, añadiéndole la cruz dorada de Guillermo el Conquistador.

Su Majestad la Reina describió así la bandera: una cruz dorada superpuesta a una cruz de San Jorge (que es la imagen de la cruz del estandarte de Guillermo el Conquistador). La nueva bandera se izó por primera vez el 9 de mayo de 1985, en honor del 40 aniversario de la liberación de la isla de la ocupación durante la II Guerra Mundial. La cruz roja de San Jorge figura también en las banderas de Alderney y Sark, por lo que es un tema común en las banderas utilizadas en la Bailía de Guernsey.