La bandera de Niue, adoptada oficialmente tras conseguir la autonomía en 1975, es un paño amarillo con una Union Jack modificada colocada en el cantón de la bandera, es decir, con cinco estrellas doradas, donde una estrella más grande está en el centro de un disco azul y otras 4 estrellas más pequeñas están dispuestas en forma de cruz.
Niue fue anexionada por Gran Bretaña el 21 de abril de 1900. Esto ocurrió después de que el rey de Niue pidiera protección y anexión a Gran Bretaña. La isla intentó establecer relaciones diplomáticas exteriores al sentirse amenazada por otras potencias coloniales. En ese momento se utilizó la bandera británica, ya que la isla pasó a formar parte del Imperio Británico.
Después, el 11 de junio de 1901, la isla pasó a formar parte de la colonia de Nueva Zelanda. Gran Bretaña cedió la custodia a Nueva Zelanda, puesto que ésta ya tenía bajo su tutela las islas Cook, y Niue se anexionó como parte de estos territorios. Algunas fuentes indican que esta etapa se produjo en 1903, pero esto puede deberse a la finalización oficial de los trámites y procesos de traspaso de Niue a la custodia de Nueva Zelanda. Sin embargo, la mayoría de las fuentes indican que fue en junio de 1901 cuando Niue pasó de Gran Bretaña a Nueva Zelanda. Desde entonces, la bandera neozelandesa se utiliza en las celebraciones oficiales y en las instituciones administrativas.
Niue obtuvo el estatus de autonomía el 19 de octubre de 1974, como resultado de un proceso constitucional organizado con el apoyo de Nueva Zelanda. Antes de la concesión del autogobierno se celebró un referéndum en el que la mayoría de la población de Niue apoyó este paso, aunque tenía la opción de seguir formando parte de Nueva Zelanda. Según el acuerdo, Niue recibió plena autonomía en asuntos internos, el derecho a tener su propia constitución, gobierno y legislación, pero conservó una relación especial con Nueva Zelanda. La isla se convirtió en un estado libremente asociado a Nueva Zelanda, que es responsable de la defensa y las relaciones internacionales de Niue, al tiempo que le proporciona asistencia económica y técnica.
La bandera actual de Niue fue adoptada oficialmente el 15 de octubre de 1975, aproximadamente un año después de que Niue obtuviera el estatus de autogobierno en libre asociación con Nueva Zelanda. La bandera fue diseñada por Patricia Rex, esposa del primer Primer Ministro de Niue, Sir Robert Rex. El diseño de la bandera incluye la Union Jack, símbolo de los lazos históricos de Niue con el Reino Unido. Las cuatro pequeñas estrellas que rodean la Union Jack representan la estrecha relación de Niue con Nueva Zelanda, y la gran estrella del centro simboliza el estatus de Niue como país autónomo del Pacífico.
