Antes de llamarse Vanuatu, el territorio se denominaba Nuevas Hébridas durante la dominación colonial. Los primeros en visitar estas islas fueron los españoles, concretamente Pedro Fernández en 1606. Sin embargo, su estancia en la isla fue breve y no tuvo un impacto significativo en la historia posterior. De 1887 a 1906, las islas fueron administradas por la colonia anglo-francesa. Fue un periodo de protectorado conjunto de Gran Bretaña y Francia, que comenzó formalmente en 1887. Al mismo tiempo, se creó una comisión naval conjunta para proteger a los ciudadanos de ambos países. Durante este periodo, en las Nuevas Hébridas existían escuelas, tribunales y otras estructuras tanto británicas como francesas. La bandera de aquel periodo consistía en dos franjas verticales de color blanco y rojo y un rectángulo azul en el centro que, a su vez, contenía cinco estrellas blancas de cinco puntas dispuestas en forma trapezoidal.

Este periodo sentó las bases para la formación del condominio en 1906, cuando el Reino Unido y Francia establecieron oficialmente la administración conjunta de las Nuevas Hébridas, que duró hasta la independencia de Vanuatu en 1980. El sistema de condominio partía de la base de que ambos países tenían sus propios sistemas administrativos, jurídicos y educativos, lo que se reflejaba en los símbolos y banderas. Así, en todos los edificios gubernamentales lucían simultáneamente dos banderas: la tricolor francesa y la Union Jack británica.
Durante la Segunda Guerra Mundial, de 1940 a 1944, Francia estuvo dividida en dos partes: el norte ocupado por los alemanes y la Francia de Vichy en el sur, formalmente independiente pero en realidad un régimen colaboracionista que colaboraba con la Alemania nazi. El simbolismo de la bandera francesa permaneció prácticamente inalterado durante este periodo, a saber, tres franjas verticales de color azul, blanco y rojo:
- El azul se asocia con el ideal revolucionario de libertad y la tradición republicana;
- El blanco simboliza la monarquía y la realeza;
- El rojo representa la revolución, la fraternidad y la sangre derramada por la libertad.

Aunque el simbolismo de la bandera permaneció inalterado, el uso de la bandera en diferentes partes de Francia tenía diferentes significados políticos. En la Francia de Vichy, la Tricolor se utilizaba junto con los símbolos del régimen de Vichy, que pretendía resaltar los valores tradicionales al tiempo que cooperaba con los ocupantes nazis.
Durante este periodo, apareció la bandera de la resistencia bajo el general Charles de Gaulle, que parecía una tricolor normal, pero con un símbolo adicional: la Cruz de Lorena. Esta cruz se convirtió en el emblema de la Francia Libre y simbolizaba la lucha contra la ocupación nazi y el régimen colaboracionista de Vichy. La cruz de Lorena fue elegida por varias razones: procedía de la región de Lorena, que simbolizaba la lucha por recuperar los territorios perdidos anexionados por Alemania; servía de contraste con la esvástica nazi, simbolizando los valores cristianos y la oposición a la ideología pagana y totalitaria del nazismo; la cruz era fácilmente identificable por la población francesa y los Aliados, uniendo fuerzas en la lucha contra la ocupación y el colaboracionismo. Tras la liberación de Francia en 1944, la Tricolor volvió a ser la única bandera oficial del país, simbolizando la restauración de los valores republicanos y la unidad nacional.

La bandera británica, en cambio, permaneció casi inalterada durante todo el periodo de existencia del condominio, e incluso si se colocan las dos variantes una al lado de la otra, es difícil notar inmediatamente las diferencias y parece que son exactamente iguales. Sin embargo, la bandera de 1906-1953 y la de 1953-1980 difieren en el escudo de armas, concretamente en el diseño de la corona.

Además, de 1969 a 1980, el Reino Unido y Francia compartieron un escudo con los siguientes símbolos:
- La bandera francesa cruzada a la izquierda y la Union Jack británica a la derecha simbolizan la administración conjunta de las Nuevas Hébridas;
- Las letras "E II R" representan a la reina Isabel II. La abreviatura "E II R" significa "Elizabeth II Regina", es decir, "Isabel II la Reina". Se trata de una designación estándar para los monarcas británicos;
- Las siglas "RF" significan "République Française", es decir, "República Francesa". Una fascia es un haz de varas de madera atadas, a menudo con un hacha. Simbolizan el poder, la ley y el gobierno. En la antigua Roma, los lictores llevaban un haz de fascias durante las procesiones con un juez, y a veces se utilizaban varas de abedul como castigo para obligar a los súbditos a obedecer las órdenes del tribunal.